RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-215ENST00000478911 NPTX2P47972 431 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ALDH9A1P49189 494 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CPT1AP50416 773 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 DGKEP52429 567 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 VAV2P52735 878 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 INHBEP58166 350 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SATB1Q01826 763 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 KRT17Q04695 432 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 FPGSQ05932 587 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 MYO1EQ12965 1108 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 RESTQ13127 1097 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TRIM14Q14142 442 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 INSCQ1MX18 579 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PLAG1Q6DJT9 500 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ARMC6Q6NXE6 501 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 MICALCLQ6ZW33 695 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 C1orf210Q8IVY1 113 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF276Q8N554 614 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SNX19Q92543 992 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ADAM2Q99965 735 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF341Q9BYN7 854 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PPCSQ9HAB8 311 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 DKK4Q9UBT3 224 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 NOX1Q9Y5S8 564 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CDY1Q9Y6F8 540 aa4□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 FFAR2O15552 330 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 KCNQ3O43525 872 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 NBNO60934 754 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CDKL5O76039 1030 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TPH1P17752 444 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 KCNA3P22001 575 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 GATA3P23771 443 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CD6P30203 668 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 COPAP53621 1224 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ICA1Q05084 483 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF575Q86XF7 245 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF527Q8NB42 609 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF384Q8TF68 577 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 MYEOVQ96EZ4 313 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 RGL1Q9NZL6 768 aa3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 A0A0B4J269 797 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 UNC119BA6NIH7 251 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 AQP7P3A6NL99 342 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 F5H697 171 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PODXLO00592 558 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TRIAP1O43715 76 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PIAS2O75928 621 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SPDEFO95238 335 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 CSF1RP07333 972 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 C1SP09871 688 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TYRP1P17643 537 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 LAG3P18627 525 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 ITGA8P53708 1063 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 SCAPQ12770 1279 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 TUBB3Q13509 450 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 RAB30Q15771 203 aa3.98□□□□□ -1.77
SUPT20H-215ENST00000478911 NRN1LQ496H8 165 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms