RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469535.5

CD46-212, Transcript of CD46 molecule, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD46, Length 7,826 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46-212ENST00000469535 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 HORMAD1Q86X24 394 aa7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MED8Q96G25 268 aa7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SPG21Q9NZD8 308 aa7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 RNF112Q9ULX5 631 aa7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 FAM50BQ9Y247 325 aa7.33□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 A8MX80 341 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 TLL1O43897 1013 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 POLBP06746 335 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ITGB6P18564 788 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 KRT4P19013 534 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 IL10P22301 178 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CNTN1Q12860 1018 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 TRADDQ15628 312 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MTA3Q9BTC8 594 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PLA2R1Q13018 1463 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 NFIBO00712 420 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MSH4O15457 936 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ARP10275 920 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 LHX1P48742 406 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PSEN2P49810 448 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ERFP50548 548 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ATL2Q8NHH9 583 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MSH3P20585 1137 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SRGNP10124 158 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 FAXCQ5TGI0 409 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CENPPQ6IPU0 288 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 GJB7Q6PEY0 223 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SHC4Q6S5L8 630 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SGF29Q96ES7 293 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 TRIM9Q9C026 710 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 YY1AP1Q9H869 796 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 OGTO15294 1046 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CYTH3O43739 400 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 VPS26AO75436 327 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 INSRRP14616 1297 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SCNN1BP51168 640 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 GEMP55040 296 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MIER2Q8N344 545 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 RDM1Q8NG50 284 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 CST8O60676 142 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ANXA9O76027 345 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 NUDT14O95848 222 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 GSNP06396 782 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PLA2G4AP47712 749 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SOX10P56693 466 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ERVK-9P63128 1117 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 ERVK-24P63145 666 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 EDEM1Q92611 657 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 NLNQ9BYT8 704 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 NT5MQ9NPB1 228 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 AMACRQ9UHK6 382 aa7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 IL1R1P14778 569 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PRIM2P49643 509 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 SCOCQ9UIL1 159 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 LAMC1P11047 1609 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 PGK1P00558 417 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 NAMPTP43490 491 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 RAB27AP51159 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CD46-212ENST00000469535 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms