RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 CHFRQ96EP1 664 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 LOXL4Q96JB6 756 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 LPIN3Q9BQK8 851 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KCTD10Q9H3F6 313 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CHD6Q8TD26 2715 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ZNF233A6NK53 670 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 EPN2O95208 641 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 IL18RAPO95256 599 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 HOXC13P31276 330 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PRCPP42785 496 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 VEPH1Q14D04 833 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CEP68Q76N32 757 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TTC8Q8TAM2 541 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SPATA20Q8TB22 786 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GAB3Q8WWW8 586 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GCNAQ96QF7 691 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 DSEQ9UL01 958 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 C2CD2Q9Y426 696 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 AKAP3O75969 853 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 RAP1GAPP47736 663 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SMARCB1Q12824 385 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 STIM1Q13586 685 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CEP295Q9C0D2 2601 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ASB7Q9H672 318 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 HPS4Q9NQG7 708 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 FRYQ5TBA9 3013 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PDXKO00764 312 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TM4SF5O14894 197 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CLSTN1O94985 981 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 NR2F2P24468 414 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CASP4P49662 377 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TSG101Q99816 390 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 THADAQ6YHU6 1953 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SOBPA7XYQ1 873 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PSMA7O14818 248 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 MBD3O95983 291 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KRT19P08727 400 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ZNF806P0C7X5 589 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PMLP29590 882 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TAF6P49848 677 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 STX17P56962 302 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CYP24A1Q07973 514 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 MORC3Q14149 939 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 IL31Q6EBC2 164 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 FNBP1Q96RU3 617 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PTPRJQ12913 1337 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms