RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424431.3

C9orf57-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 57, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf57, Length 1,297 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57-202ENST00000424431 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 GPR20Q99678 358 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SPON1Q9HCB6 807 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TNKSO95271 1327 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SHTN1A0MZ66 631 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CCDC69A6NI79 296 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 FZD9O00144 591 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ZBTB43O43298 467 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 NT5C2P49902 561 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 RCAN1P53805 252 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CACNB3P54284 484 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CDK17Q00537 523 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PICALMQ13492 652 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CDSNQ15517 529 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 DGKHQ86XP1 1220 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 FANCBQ8NB91 859 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 EDAQ92838 391 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TCF25Q9BQ70 676 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 DNAJC18Q9H819 358 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CNTNAP1P78357 1384 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TCHHQ07283 1943 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ENTPD3O75355 529 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 MTHFD2P13995 350 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 IFNAR1P17181 557 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PDCP20941 246 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 GUCY1A2P33402 732 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SHMT1P34896 483 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 MTNR1BP49286 362 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TCP10Q12799 353 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 RESTQ13127 1097 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 MTMR1Q13613 665 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 MICU3Q86XE3 530 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 IQCA1Q86XH1 822 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PHKBQ93100 1093 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 AIFM3Q96NN9 605 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SBF1O95248 1867 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ERICH2A1L162 156 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TRIM75PA6NK02 468 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TSPY2A6NKD2 308 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ALG1L2C9J202 215 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 AKR1B1P15121 316 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 CTSSP25774 331 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 NPEPPSP55786 919 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 WNT3AP56704 352 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 ANO4Q32M45 955 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf57-202ENST00000424431 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms