RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	BTBD19	C9JJ37	291 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	COPE	O14579	308 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	AP1G1	O43747	822 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	IFNB1	P01574	187 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SERPINA6	P08185	405 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	KRT7	P08729	469 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SFN	P31947	248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RTP1	P59025	263 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	NFIA	Q12857	509 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	HIC1	Q14526	733 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	KAZN	Q674X7	775 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TTC17	Q96AE7	1141 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	STK32B	Q9NY57	414 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SOX13	Q9UN79	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	BIRC5	O15392	142 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PEX1	O43933	1283 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	AOC1	P19801	751 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	BGN	P21810	368 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	MMP8	P22894	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	AMPD1	P23109	780 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	SSTR1	P30872	391 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	CDKN2B	P42772	138 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PSMC5	P62195	406 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	WASHC5	Q12768	1159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	CUL2	Q13617	745 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PSMD6	Q15008	389 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	ZACN	Q401N2	412 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	ARC	Q7LC44	396 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	CPT1B	Q92523	772 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023		Q9H521	79 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	EXTL3	O43909	919 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	TMCC1	O94876	653 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	KLHL2	O95198	593 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	MYL4	P12829	197 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	KRT10	P13645	584 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	UQCRB	P14927	111 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PPARG-208	ENST00000397023	DSG3	P32926	999 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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