RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381346.8

RDH11-201, Transcript of retinol dehydrogenase 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RDH11, Length 2,588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH11-201ENST00000381346 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 MARCH6O60337 910 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ATP6V1B1P15313 513 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 CDH3P22223 829 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 CA4P22748 312 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 CHKAP35790 457 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ENTPD1P49961 510 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 DMPKQ09013 629 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 LPCAT4Q643R3 524 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 KCNK18Q7Z418 384 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FBXO11Q86XK2 927 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FAM151AQ8WW52 585 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ALG3Q92685 438 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 EME1Q96AY2 570 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 THTPAQ9BU02 230 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.51□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 A0A088AWK7 358 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ITM2AO43736 263 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 CD48P09326 243 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 UCHL3P15374 230 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 NCKAP1LP55160 1127 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 NCOA4Q13772 614 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TMC7Q7Z402 723 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 NLRX1Q86UT6 975 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 BORCS5Q969J3 196 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 VPS33BQ9H267 617 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 GIN1Q9NXP7 522 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 H3BRJ5 948 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TBX3O15119 743 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TGDSO95455 350 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RSPH10BP0C881 870 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 PTPN2P17706 415 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 LMNB1P20700 586 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 PMLP29590 882 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FDFT1P37268 417 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 BAG6P46379 1132 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 STT3AP46977 705 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TUBA4AP68366 448 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RASA2Q15283 850 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 DLGAP5Q15398 846 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SLC1A5Q15758 541 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ECM1Q16610 540 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 USP41Q3LFD5 358 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 IL23RQ5VWK5 629 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SNF8Q96H20 258 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.5□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 COL4A5P29400 1685 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 PIK3CDO00329 1044 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FCHO1O14526 889 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RAD17O75943 681 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ABHD2P08910 425 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 KRT15P19012 456 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SREBF1P36956 1147 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 APOFQ13790 326 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TRIP10Q15642 601 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 DYMQ7RTS9 669 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TDRPQ86YL5 185 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 USP33Q8TEY7 942 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SLCO2A1Q92959 643 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 SGF29Q96ES7 293 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 HAUS8Q9BT25 410 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDH11-201ENST00000381346 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms