RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TK2O00142 265 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 AKAP10O43572 662 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 JADE3Q92613 823 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ANKS1AQ92625 1134 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF333Q96JL9 665 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 STRNO43815 780 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 HES6Q96HZ4 224 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CES2O00748 559 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 LLGL1Q15334 1064 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CYTH1Q15438 398 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 Q4G0T1 1027 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DNERQ8NFT8 737 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ARL8AQ96BM9 186 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ERP27Q96DN0 273 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 STK39Q9UEW8 545 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TMCO1Q9UM00 188 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CSF1RP07333 972 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 WDR93Q6P2C0 686 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ITIH5Q86UX2 942 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 E2F7Q96AV8 911 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM260Q9NX78 707 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM120BA0PK00 339 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF26B4DH59 902 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 F5H5T6 163 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 LHX1P48742 406 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CEP44Q9C0F1 390 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 STMN3Q9NZ72 180 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF839A8K0R7 811 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 LRG1P02750 347 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC159P0C7I6 412 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TCF3P15923 654 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEA4P43358 317 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3CGP48736 1102 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 FCGRTP55899 365 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PTPN21Q16825 1174 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 HINFPQ9BQA5 517 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ITGALP20701 1170 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PPP4CP60510 307 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAPK7Q13164 816 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 EXD1Q8NHP7 514 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CNBD2Q96M20 576 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 VWA5AO00534 786 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GRK2P25098 689 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ASB2Q96Q27 587 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RAD18Q9NS91 495 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MYH7P12883 1935 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINB1P30740 379 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SREBF1P36956 1147 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 VHLP40337 213 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KRT78Q8N1N4 520 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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