RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 OSBPL7Q9BZF2 842 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 LGALS13Q9UHV8 139 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 CITO14578 2027 aa18.51■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 UBA3Q8TBC4 463 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 ACTL9Q8TC94 416 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 C10orf88Q9H8K7 445 aa18.5■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.5■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 TTC25Q96NG3 672 aa18.49■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.48■□□□□ 0.55
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SPNS1-202ENST00000323081 TINF2Q9BSI4 451 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 USP18Q9UMW8 372 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 C2CD2Q9Y426 696 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 TCP11X1B4DZS4 312 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 PIK3R2O00459 728 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 NDC80O14777 642 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-202ENST00000323081 ACVR2BQ13705 512 aa18.47■□□□□ 0.55
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