RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 SLCO2A1Q92959 643 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MIPEPQ99797 713 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC77Q9BR77 488 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SOCS7O14512 581 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CNMDO75829 334 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 KRT36O76013 467 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SKIP12755 728 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RASSF2P50749 326 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 USP37Q86T82 979 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 OCEL1Q9H607 264 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 OTOFQ9HC10 1997 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DCTN3O75935 186 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CHST13Q8NET6 341 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DNERQ8NFT8 737 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NLRP4Q96MN2 994 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ADCY3O60266 1144 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 FAM189A1O60320 539 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MSCO60682 206 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PYGBP11216 843 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 KRT10P13645 584 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RAP1GAPP47736 663 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MAMLD1Q13495 774 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GPC2Q8N158 579 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CLCN3P51790 818 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 IGBP1P78318 339 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CENPCQ03188 943 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 KAZNQ674X7 775 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CAPN9O14815 690 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TJP3O95049 919 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 IQCF3P0C7M6 154 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 KRT15P19012 456 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PTPN4P29074 926 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GSTT1P30711 240 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 P3H1Q32P28 736 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CGRRF1Q99675 332 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 STAM2O75886 525 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ASMTLO95671 621 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GSTA2P09210 222 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GBP5Q96PP8 586 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CSADQ9Y600 493 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 EDNRBP24530 442 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MAGEA4P43358 317 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PTP4A2Q12974 167 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 C10orf82Q8WW14 230 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TFAP2BQ92481 460 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 HAUS1Q96CS2 278 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 POLIQ9UNA4 740 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 OGDHQ02218 1023 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CAV1Q03135 178 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TBX10O75333 385 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MAN1A1P33908 653 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 STAT4Q14765 748 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms