RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297979.9

C9orf3-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf3, Length 2,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-202ENST00000297979 MIOSQ9NXC5 875 aa15.02■□□□□ -0
C9orf3-202ENST00000297979 NFU1Q9UMS0 254 aa15.02■□□□□ -0
C9orf3-202ENST00000297979 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
C9orf3-202ENST00000297979 FAM187AA6NFU0 413 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CYB561D2O14569 222 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TCF4P15884 667 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CUL1Q13616 776 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TNIP3Q96KP6 325 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RSAD1Q9HA92 442 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PODXLO00592 558 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 FAM163BP0C2L3 166 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SKIP12755 728 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RNF169Q8NCN4 708 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 159.8
C9orf3-202ENST00000297979 CAVIN3Q969G5 261 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ITFG2Q969R8 447 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PGBD4Q96DM1 585 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RAB17Q9H0T7 212 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RGS7P49802 495 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 NNTQ13423 1086 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 LLGL1Q15334 1064 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TRADDQ15628 312 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PMF1Q6P1K2 205 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 OSTM1Q86WC4 334 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 EMC1Q8N766 993 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 STK32AQ8WU08 396 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TRIM17Q9Y577 477 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 KBTBD13C9JR72 458 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TULP2O00295 520 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 KRT1P04264 644 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CCDC130P13994 396 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CETN2P41208 172 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 FNTAP49354 379 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CLCNKBP51801 687 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 BCAT1P54687 386 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SNX16P57768 344 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TTC27Q6P3X3 843 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RCOR2Q8IZ40 523 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SEC14L1Q92503 715 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 35.1
C9orf3-202ENST00000297979 UBN1Q9NPG3 1134 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PHF24Q9UPV7 400 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PIK3R2O00459 728 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RALAP11233 206 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ADORA2BP29275 332 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 COILP38432 576 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 WSCD1Q658N2 575 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 POLNQ7Z5Q5 900 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 JAMLQ86YT9 394 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 SENP8Q96LD8 212 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 LRRC19Q9H756 370 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 KLHL11Q9NVR0 708 aa15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ARVCFO00192 962 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 PTGIRP43119 386 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ACAP1Q15027 740 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 TMEM110Q86TL2 294 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 GABRDO14764 452 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 LRCH4O75427 683 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 YY1P25490 414 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 CBX1P83916 185 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf3-202ENST00000297979 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms