RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 APBB3O95704 486 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 LDHAP00338 332 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GAP43P17677 238 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GBP1P32455 592 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 DGKEP52429 567 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 RBP5P82980 135 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 EML3Q32P44 896 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 RNF43Q68DV7 783 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SYT13Q7L8C5 426 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ATP2A3Q93084 1043 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MYRFLQ96LU7 910 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PANK2Q9BZ23 570 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MTMR12Q9C0I1 747 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TMEM206Q9H813 350 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ABCB6Q9NP58 842 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SIX4Q9UIU6 781 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.94■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ANTXRLA6NF34 631 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 HDCP19113 662 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PMLP29590 882 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SEC13P55735 322 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 USP4Q13107 963 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 KCNB1Q14721 858 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ELF2Q15723 593 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CXorf38Q8TB03 319 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ACDQ96AP0 544 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TPSD1Q9BZJ3 242 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 RHOBTB1O94844 696 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 KCNK5O95279 499 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GARTP22102 1010 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PCSK1P29120 753 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 LHX1P48742 406 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 NR1H3Q13133 447 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 C2orf27AQ580R0 203 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 FSIP1Q8NA03 581 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 EDEM2Q9BV94 578 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GCNT4Q9P109 453 aa18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 THADAQ6YHU6 1953 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GABRDO14764 452 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CAVIN2O95810 425 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PDGFRBP09619 1106 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 LMO2P25791 158 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GRIK1P39086 918 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TXLNAP40222 546 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TTC30AQ86WT1 665 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TSTD1Q8NFU3 115 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MYLPFQ96A32 169 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SYT15Q9BQS2 421 aa18.92■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 NUP205Q92621 2012 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 C4orf47A7E2U8 309 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 BDNFP23560 247 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CYP27A1Q02318 531 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MYO1EQ12965 1108 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 FAM171BQ6P995 826 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GPD1LQ8N335 351 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 HPDLQ96IR7 371 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PANK4Q9NVE7 773 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 EBF1Q9UH73 591 aa18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 PTPRJQ12913 1337 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MAGEA11P43364 429 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 USP46P62068 366 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ANO7Q6IWH7 933 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 OLFML3Q9NRN5 406 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 INTS13Q9NVM9 706 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.9■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.89■□□□□ 0.62
CABP1-201ENST00000288616 GON4LQ3T8J9 2241 aa18.89■□□□□ 0.61
CABP1-201ENST00000288616 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms