RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CCNG2Q16589 344 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 Q4G0T1 1027 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 VPS37AQ8NEZ2 397 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MUC3BQ9H195 1237 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ENO4A6NNW6 628 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 THRAP10827 490 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 OVGP1Q12889 678 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SCN3BQ9NY72 215 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 GEMP55040 296 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1GB0I1T2 1018 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A3P11169 496 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DGKDQ16760 1214 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CNDP1Q96KN2 507 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DPP3Q9NY33 737 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 EVPLLA8MZ36 301 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DGKIO75912 1065 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SCTRP47872 440 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT2P50583 147 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ST8SIA6P61647 398 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 NPTXRO95502 500 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 NPTX2P47972 431 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 USP32Q8NFA0 1604 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 RHOBTB1O94844 696 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CNTFP26441 200 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB3P29508 390 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TWF1Q12792 350 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CHSY1Q86X52 802 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 KRT8P05787 483 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF7Q14155 803 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CGRRF1Q99675 332 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 E7ENQ6 273 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP3O75969 853 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DSG1Q02413 1049 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 RCN1Q15293 331 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA13Q9P0J0 144 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DTNAQ9Y4J8 743 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 M0R3G1 203 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB8P50452 374 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 GMCL1Q96IK5 515 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 M0QYT0 321 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ASMTLO95671 621 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 F9P00740 461 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 FAXCQ5TGI0 409 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CHRM3P20309 590 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 RRM1P23921 792 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 POU4F1Q01851 419 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 RUNX1T1Q06455 604 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 LAYNQ6UX15 382 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 APBB2Q92870 758 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DDIT4Q9NX09 232 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB39O15060 712 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 WDR47O94967 919 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN7P35236 360 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 PTENP60484 403 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 KCNMA1Q12791 1236 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5DQ92835 1189 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC40Q9H9A6 602 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CEP152O94986 1710 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms