RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.37□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PGM1P36871 562 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 GRIN1Q05586 938 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SPATA21Q7Z572 469 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 WDR24Q96S15 920 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 A0A1B0GTH6 734 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PGK1P00558 417 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 HMOX2P30519 316 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 BCAT1P54687 386 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 MAP3K7CLP57077 242 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 MED21Q13503 144 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 AMACRQ9UHK6 382 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ERFP50548 548 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CHP1Q99653 195 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CGRRF1Q99675 332 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 KCNA3P22001 575 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 NCAPHQ15003 741 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.36□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 XYLBO75191 536 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 AKAP5P24588 427 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CASP4P49662 377 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SOX10P56693 466 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 STARD3Q14849 445 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 MTFR1Q15390 333 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 VPS28Q9UK41 221 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 KRT8P05787 483 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PYGLP06737 847 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 POTEAQ6S8J7 498 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TMEM199Q8N511 208 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.35□□□□□ -0.115e-10■■■□□ 14.8
USP22-201ENST00000261497 CCDC22O60826 627 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 HLA-DPA1P20036 260 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CASP7P55210 303 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 NAB2Q15742 525 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ITSN1Q15811 1721 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 GLTPD2A6NH11 291 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PMPCBO75439 489 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.35□□□□□ -0.114e-7■■□□□ 11.7
USP22-201ENST00000261497 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CALML6Q8TD86 181 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ADAM2Q99965 735 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SYT15Q9BQS2 421 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.35□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ENDOD1O94919 500 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CKBP12277 381 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PAK5Q9P286 719 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 NWD1Q149M9 1564 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TM4SF1P30408 202 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 MAP2K5Q13163 448 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 GIT2Q14161 759 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 CNGA3Q16281 694 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 GJB7Q6PEY0 223 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.34□□□□□ -0.11
USP22-201ENST00000261497 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms