RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100497.10

Actb-201, Transcript of Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Actb, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Dendrite, Endoplasmic reticulum, Exosome, Growth cone, Lamellipodium, Perinuclear, Ribosome, Somatodendritic compartment .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actb-201ENSMUST00000100497 Pcdha10Q91Y20 946 aa12.86□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mfsd5Q921Y4 450 aa12.86□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ogfod2Q9CQ04 349 aa12.86□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem59Q9QY73 323 aa12.86□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ggt5Q9Z2A9 573 aa12.86□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc4a11A2AJN7 862 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Top6blJ3QMY9 579 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 PorP37040 678 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Pkn1P70268 946 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 GsapQ3TCV3 858 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Cnga4Q3UW12 575 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kif11Q6P9P6 1052 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Usp6nlQ80XC3 819 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Q80Y73 168 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Pyhin1Q8BV49 420 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mbtps2Q8CHX6 515 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kctd15Q8K0E1 283 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Spag16Q8K450 639 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 BlmhQ8R016 455 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Zkscan3Q91VW9 553 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 GzmnQ920S1 248 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 PawrQ925B0 333 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Lztr1Q9CQ33 837 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Micu3Q9CTY5 523 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mms19Q9D071 1031 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fundc1Q9DB70 155 aa12.85□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ssxb9A2BI93 185 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Apol7bB1AQP7 369 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 FancfE9Q5Z5 343 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21962L7N280 338 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Adam19O35674 920 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ap1g2O88512 791 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gnrh1P13562 90 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc1a2P43006 572 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Nlrc4Q3UP24 1024 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Apol7eQ3UZ24 369 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Arhgap44Q5SSM3 814 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp943Q6NZP4 507 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Bank1Q80VH0 783 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Prpsap2Q8R574 369 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam114a2Q8VE88 497 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mtmr14Q8VEL2 648 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 NamptQ99KQ4 491 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gstt4Q9D4P7 240 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gdap2Q9DBL2 498 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Extl1Q9JKV7 669 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp236S4R299 1847 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Scn1aA2APX8 2009 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm12394A2AKP6 982 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trim5E9PV98 497 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm4302E9PX25 294 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 LctF8VPT3 1931 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 DffaO54786 331 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 VimP20152 466 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kcnn2P58390 839 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Casp4P70343 373 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ifnl2Q4VK74 193 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kansl1lQ5DTI6 991 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Wnk4Q80UE6 1222 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Wscd1Q80XH4 572 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Efcab14Q8BGQ6 484 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fbxw21Q8BI38 468 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Dpp9Q8BVG4 862 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Q8CD60 292 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1502Q8VG66 316 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Snrnp25Q8VIK1 123 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Chst12Q99LL3 419 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Them5Q9CQJ0 248 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mageb3Q9D2H4 330 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 GOLGA7BQ9D428 167 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ttc33Q9D6K7 262 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gfra4Q9JJT2 260 aa12.84□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn2r59E9PUT5 865 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Rap1gds1E9Q912 607 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Ptpn9O35239 593 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Fgf15O35622 218 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 StrnO55106 780 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Diaph2O70566 1098 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Mcpt4P21812 246 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Glb1P23780 647 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Igfbp4P47879 254 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Nab1Q61122 486 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf185Q62394 352 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Rad54bQ6PFE3 886 aa12.83□□□□□ -0.36
Actb-201ENSMUST00000100497 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms