RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prl3a1Q78Y73 227 aa12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Impg2Q80XH2 1243 aa12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc2a12Q8BFW9 622 aa12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc91Q9D8L5 442 aa12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lonp2Q9DBN5 852 aa12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa12.38□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmod3E9QA62 571 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2q1Q7TSS2 422 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 TraipQ8VIG6 470 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 NamptQ99KQ4 491 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acbd6Q9D061 282 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Capn10Q9ESK3 666 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vti1aO89116 217 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgfr1P16092 822 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gja8P28236 440 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 CttnQ60598 546 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef10Q8C033 1345 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spatc1lQ9D9W0 342 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 IvdQ9JHI5 424 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt27Q9Z320 448 aa12.37□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7694J3QNH8 270 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01650 108 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01653 108 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abi2P62484 446 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifa6Q0VGU8 367 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tspyl3Q3UYP3 334 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp658Q5PPQ4 887 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab34Q64008 259 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mageb18Q8BQR7 327 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhpn2Q8BWR8 686 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epn2Q8CHU3 595 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gle1Q8R322 699 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpp3Q99KK7 738 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pbx4Q99NE9 378 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Caln1Q9JJG7 219 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mta2Q9R190 668 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam81bA0A140LI28 432 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptp4a2O70274 167 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf235Q61116 645 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Txndc8Q69AB2 127 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr412Q7TRW7 312 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8BGD0 127 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nod1Q8BHB0 953 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ftsj1Q8CBC7 324 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dr1Q91WV0 176 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pip4k2cQ91XU3 421 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epm2aQ9WUA5 330 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5483B2RV77 97 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsg1l2M0QWL6 290 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp42P22227 288 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btbd1P58544 488 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col19a1Q0VF58 1136 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubn1Q4G0F8 1135 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rad9bQ6WBX7 403 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Creb3l2Q8BH52 521 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D4A5 307 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Strn3Q9ERG2 796 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 TfgQ9Z1A1 397 aa12.36□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dock3Q8CIQ7 2027 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700001O22RikA2APZ1 375 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1023A2ASU6 311 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1305A2AVW3 312 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Speer2E9Q9U2 264 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mvb12bQ6KAU4 317 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrsam1Q80ZI6 727 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 PisdQ8BSF4 406 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppm1kQ8BXN7 372 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm1bQ8CIG3 826 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr356Q8VFP5 315 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chmp2aQ9DB34 222 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 DpysQ9EQF5 519 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10720D3Z1I5 223 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 AlpiF8VPQ6 554 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Per2O54943 1257 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mdh1P14152 334 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nrp1P97333 923 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xkr5Q5GH66 676 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc20a1Q61609 681 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc16Q80TN4 772 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npas4Q8BGD7 802 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apol9bQ8C7I4 310 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apol9aQ8VDU3 310 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 PawrQ925B0 333 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tpgs1Q99MS8 303 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl2bpQ9D385 163 aa12.35□□□□□ -0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcaf6Q9DC22 876 aa12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.6 ms