RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr2c2P49117 596 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptprn2P80560 1001 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tespa1Q3U132 458 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msantd2Q6NZR2 559 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Papd7Q6PB75 542 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scd4Q6T707 353 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem169Q8BG50 297 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ca9Q8VHB5 437 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tti1Q91V83 1085 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cul2Q9D4H8 745 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnbd2Q9D5U8 673 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfaip1O70479 316 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scp2P32020 547 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irf3P70671 419 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnq1P97414 668 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Parp3Q3ULW8 533 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phlda1Q62392 405 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb10Q8K1K6 397 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Als2Q920R0 1651 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AF366264G3X9P9 502 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3402K7N5P2 326 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abi3bpQ59IW6 1179 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ticam2Q8BJQ4 232 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dlgap1Q9D415 992 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MrgbpQ9DAT2 204 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem59Q9QY73 323 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atf6F6VAN0 656 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam107aQ78TU8 144 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr412Q7TRW7 312 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem161bQ8C2L6 487 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdgfcQ8CI19 345 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtse1Q8R080 741 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd9Q9CR00 222 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kifc3O35231 824 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msh3P13705 1091 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr151Q7TSN6 422 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Colgalt1Q8K297 617 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina3nQ91WP6 418 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpm5Q9JJH7 1158 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl9lQ67FY2 1494 aa13.36□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnu1O54982 1121 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrymO54983 313 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgfr1P16092 822 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pfdn4Q3UWL8 134 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prkaa1Q5EG47 559 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmprss11eQ5S248 423 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bfsp2Q6NVD9 416 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rad9bQ6WBX7 403 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bag5Q8CI32 447 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf654Q9DAU9 571 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btnl4A2CG29 586 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4871D3Z0W7 314 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3187M0QWW3 260 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtenO08586 403 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 StrnO55106 780 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam83hQ148V8 1209 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt18Q3U2V3 323 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema5bQ60519 1093 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scube3Q66PY1 993 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec23ipQ6NZC7 998 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Suds3Q8BR65 328 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem120aQ8C1E7 343 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcoln2Q8K595 566 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf31Q924T7 1066 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zmynd10Q99ML0 440 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11fip1Q9D620 645 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlr6Q9EPW9 795 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28043E0CXC2 719 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AlpiF8VPQ6 554 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tac1P41539 130 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scg3P47867 471 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfm4Q3UZZ4 505 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4952Q5FW57 296 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scarf1Q5ND28 820 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Creb3Q61817 404 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oca2Q62052 833 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccser1Q8C0C4 895 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P3h4Q8K2B0 443 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sbk1Q8QZX0 417 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.5 ms