RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tmem120aQ8C1E7 343 aa22.12■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smtnl2Q8CI12 456 aa22.12■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Alas1Q8VC19 642 aa22.12■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pcdha10Q91Y20 946 aa22.12■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prl2a1Q9JHK0 228 aa22.12■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AfpP02772 605 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cav1P49817 178 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SpertQ32MG2 446 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 InscQ3HNM7 579 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 GsapQ3TCV3 858 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Znf185Q62394 352 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tcaf3Q6QR59 914 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rccd1Q8BTU7 377 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sbk1Q8QZX0 417 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Micu3Q9CTY5 523 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Acbd6Q9D061 282 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrrc71Q9D3W5 558 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Extl1Q9JKV7 669 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Phf2Q9WTU0 1096 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Krt27Q9Z320 448 aa22.11■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc170D3YXL0 722 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr95D3Z7A8 784 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trappc3O55013 180 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ap1g2O88512 791 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Soat2O88908 525 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TdgP56581 421 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pcsk1P63239 753 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cfhr2Q4LDF6 332 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wnk4Q80UE6 1222 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tmem260Q8BMD6 703 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Iqsec1Q8R0S2 961 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc35f6Q8VE96 372 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rec114Q9CWH4 259 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sgk1Q9WVC6 431 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AspgA0JNU3 564 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mroh5E9PUJ8 762 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adam19O35674 920 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 RargP18911 458 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ercc5P35689 1170 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Msh2P43247 935 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trim38Q5SZ99 471 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tfdp2Q64163 446 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mysm1Q69Z66 819 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrgprb8Q7TN51 330 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam43aQ8BUP8 424 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Iffo1Q8BXL9 562 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 St6galnac4Q9R2B6 360 aa22.1■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Vmn2r121A2BE32 847 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Usp35M0QWN7 1009 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prdx5P99029 210 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fbxw21Q8BI38 468 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gdap2Q9DBL2 498 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 IkbipQ9DBZ1 373 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tk2Q9R088 270 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa22.09■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ankrd16A2AS55 361 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Vmn2r17E9PYF5 849 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adgrf2E9Q4J9 644 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Capn2O08529 700 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Klc1O88447 541 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hoxc8P09025 242 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ces1cP23953 554 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zfp658Q5PPQ4 887 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap44Q5SSM3 814 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fscn1Q61553 493 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif11Q6P9P6 1052 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Btbd9Q8C726 612 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pomgnt1Q91X88 660 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Iqcf1Q9D9K8 182 aa22.08■■□□□ 1.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Bfsp1A2AMT1 669 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm16430A6X8J1 155 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 RarbP22605 482 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Znf219Q6IQX8 726 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr44Q6NVE8 915 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rassf10Q8BL43 508 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr98Q8VC42 657 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cd300ldQ8VCH2 221 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Xpo6Q924Z6 1125 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ebag9Q9D0V7 213 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slxl1Q9D515 155 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PigoQ9JJI6 1093 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gfra4Q9JJT2 260 aa22.07■■□□□ 1.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zfp990B1AVN5 605 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.4 ms