RNA–Protein interactions for RNA: YNL017C

YNL017C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL017C, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL017C	YNL017C	APS2	Q00381	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	UGX2	P32772	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	YER188W	P40103	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	FIP1	P45976	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	RIM9	Q04734	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	FCY1	Q12178	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL017C	YNL017C	REP2	P03872	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	ATP5	P09457	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	TIR1	P10863	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	PHO85	P17157	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	IPT1	P38954	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YGR219W	P53307	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	SGA1	P08019	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	FCY21	P40039	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	TIR3	P40552	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	SAY1	P53324	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	VPS71	Q03433	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	ATP15	P21306	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YER134C	P40081	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YER181C	P40097	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YFL019C	P43576	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	GRX5	Q02784	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	COX10	P21592	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	SRP21	P32342	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	GEP7	P53171	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YNR064C	P53750	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	SWD3	P38123	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	GPI2	P46961	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	FYV7	Q12247	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YHR125W	P38831	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YNL017C	YNL017C	GON7	P46984	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	PIN3	Q06449	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	NAT3	Q06504	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL017C	YNL017C	YCR101C	P25607	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	DSK2	P48510	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YGL193C	P53097	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YML122C	Q03207	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	GAL83	Q04739	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YNL017C	YNL017C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YNL017C	YNL017C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	SPT14	P32363	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	KRE9	P39005	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	PAM16	P42949	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YGR017W	P53210	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	HYM1	P32464	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	SNC2	P33328	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	AIM11	P87275	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	MCH1	Q07376	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	IES3	Q12345	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	ODC2	Q99297	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YHR140W	P38842	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	PIR5	P46999	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	SCW10	Q04951	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	PAU12	P53343	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	YDR274C	P87283	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	CWC27	Q02770	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	HUT1	Q12520	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	COX9	P07255	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	TRS20	P38334	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	SAE3	P89114	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	VPS28	Q02767	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL017C	YNL017C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL017C	YNL017C	PAU24	P38155	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL017C	YNL017C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.1 ms