RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W CKS1P20486 150 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W POG1P40473 351 aa6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W TY1A-GR1Q12085 440 aa6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YLR349WYLR349W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W EMC5P40540 141 aa6.14□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YDL183CP48569 320 aa6.14□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W CAF40P53829 373 aa6.14□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W ACB1P31787 87 aa6.13□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W DAD4P69851 72 aa6.13□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YDR115WQ04598 105 aa6.13□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W DGA1Q08650 418 aa6.13□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YCR023CP25351 611 aa6.12□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YHR173CP38864 112 aa6.12□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YNR066CP53752 436 aa6.12□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YLR042CQ07990 161 aa6.12□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W HMX1P32339 317 aa6.11□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YOR015WQ12169 119 aa6.11□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YLR342W-AQ3E810 57 aa6.11□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W MED7Q08278 222 aa6.1□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W DAD1Q12248 94 aa6.1□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W AME1P38313 324 aa6.09□□□□□ -1.43
YLR349WYLR349W YAR023CD6VPM8 179 aa6.08□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YIL163CP40448 117 aa6.07□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W TAD2P47058 250 aa6.07□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W ORM2Q06144 216 aa6.06□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YLR307C-AQ3E825 87 aa6.06□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W ADD37Q03233 198 aa6.05□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YMR320WQ04897 101 aa6.05□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W TIM22Q12328 207 aa6.05□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YBR292CP38357 123 aa6.04□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W DIA1P54005 336 aa6.04□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W ERI1P62651 68 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa6.04□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W ACP1P32463 125 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YPT10P38146 199 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YBR090CP38253 122 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W SUR2P38992 349 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W COX16P47081 118 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W YGR017WP53210 297 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W ANT1Q06497 328 aa6.03□□□□□ -1.44
YLR349WYLR349W SEC59P20048 519 aa6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W PGD1P40356 397 aa6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YIL059CP40520 121 aa6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W LCL1Q02786 101 aa6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W BET5Q03630 159 aa6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W UBC5P15732 148 aa6.01□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W MAG1P22134 296 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W FZF1P32805 299 aa6.01□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W MMS2P53152 137 aa6.01□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YMR122W-AQ3E842 84 aa6.01□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa6□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W DDR48P18899 430 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YFR045WP43617 309 aa6□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W PMP3P87284 55 aa6□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W DXO1Q06349 442 aa6□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W PCC1Q3E833 88 aa6□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W SAR1P20606 190 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YBR013CP38215 129 aa5.99□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YCL001W-AP87012 153 aa5.99□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W POF1P25576 258 aa5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W TEM1P38987 245 aa5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W SMD3P43321 101 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YGL185CP53100 379 aa5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W TIM21P53220 239 aa5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W YDR029WQ12111 104 aa5.98□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W RPL12BP0CX54 165 aa5.97□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data5.97□□□□□ -1.45not detected
YLR349WYLR349W YGR026WP53217 278 aa5.97□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W UPS3Q04006 179 aa5.97□□□□□ -1.45
YLR349WYLR349W PAU4P53427 120 aa5.96□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W MIX23P38162 196 aa5.95□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W YOR105WQ08504 108 aa5.95□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W YDR010CQ12426 110 aa5.95□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W SMP1P38128 452 aa5.94□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W SRB7P47822 140 aa5.94□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W ATP19P81451 68 aa5.93□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU1P0CE88 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU14P0CE89 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU6P0CE90 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU18P0CE91 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU8P0CE92 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU11P0CE93 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W PAU13P38725 120 aa5.92□□□□□ -1.46
YLR349WYLR349W SNA2P56508 79 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.7 ms