RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeastyeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTR2YKR093W SVP26P38869 228 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W TVP23P38962 199 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YGR017WP53210 297 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YNL033WP53964 284 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SAE3P89114 91 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W GRX5Q02784 150 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W MIX17Q03667 156 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W FRQ1Q06389 190 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W WIP1Q2V2P8 89 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W RAS2P01120 322 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YER181CP40097 107 aa3.59□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YNL019CP53975 284 aa3.59□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W HRD1Q08109 551 aa3.59□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SYM1Q06563 197 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W VMA9Q3E7B6 73 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W FKS3Q04952 1785 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W SEC59P20048 519 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YEL028WP39989 153 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W PEP8P40335 379 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W RAD28Q12021 506 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YLR361C-AQ3E795 98 aa3.58□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W RAD6P06104 172 aa3.57□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W HAP2P06774 265 aa3.57□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W SPS2P08459 502 aa3.57□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
PTR2YKR093W GLC8P41818 229 aa3.57□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W PST2Q12335 198 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W DDI2P0CH63 225 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W DDI3P0CH64 225 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YBR209WP38311 105 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YHR022CP38763 256 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W GAA1P39012 614 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W MHF1Q3E835 90 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YPT31P38555 223 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YGL193CP53097 103 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W CYT2Q00873 224 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W RNH202Q05635 350 aa3.56□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W MOT1P32333 1867 aa3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W EMP24P32803 203 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W HTD2P38790 280 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W DAN1P47178 298 aa3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YDR366CP87287 132 aa3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YPL067CQ02754 198 aa3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YDR391CQ04170 232 aa3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W SUS1Q6WNK7 96 aa3.55□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YOR304C-AO14468 76 aa3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YIL134C-AQ45U18 67 aa3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W VMA21P41806 77 aa3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W ERG25P53045 309 aa3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YDR102CQ03864 110 aa3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.54□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W FAB1P34756 2278 aa3.53□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W COX5BP00425 151 aa3.53□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W UBC7Q02159 165 aa3.53□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W GPI11Q06636 219 aa3.53□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W YNR034W-AQ3E841 98 aa3.53□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W COA6Q3E846 104 aa3.53□□□□□ -1.84
PTR2YKR093W HAP3P13434 144 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W SEC11P15367 167 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W TMA19P35691 167 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YEL073CP39974 107 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W HPA3P39979 161 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W SWM2P40342 146 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W UPS3Q04006 179 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W SLO1Q3E784 85 aa3.52□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YER135CP40082 130 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W KNH1P50112 268 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W ATG10Q07879 167 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W RIF1P29539 1916 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W MPC1P53157 130 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W DYN2Q02647 92 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W RIM9Q04734 239 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W ANT1Q06497 328 aa3.51□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W FLX1P40464 311 aa3.5□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YPR013CQ12145 317 aa3.5□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W MYO1P08964 1928 aa3.5□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
PTR2YKR093W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W TIM8P57744 87 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W CSI2Q08054 341 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W MAK31P23059 88 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W UTR5P32630 166 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W SAY1P53324 424 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YNR064CP53750 290 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W LIP1Q03579 150 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YOL131WQ08270 108 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YOR015WQ12169 119 aa3.49□□□□□ -1.85
PTR2YKR093W YMR030W-AQ3E760 96 aa3.49□□□□□ -1.85
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