RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W YGL185CP53100 379 aa6.86□□□□□ -1.31
DDI1YER143W COX18P53239 316 aa6.86□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YCL001W-BQ96VH2 84 aa6.86□□□□□ -1.31
DDI1YER143W MIX23P38162 196 aa6.85□□□□□ -1.31
DDI1YER143W SPI1P40092 148 aa6.85□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YDL183CP48569 320 aa6.85□□□□□ -1.31
DDI1YER143W MOT3P54785 490 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YOR105WQ08504 108 aa6.85□□□□□ -1.31
DDI1YER143W TAR1Q8TGM6 124 aa6.85□□□□□ -1.31
DDI1YER143W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YHR212W-AP0CX91 67 aa6.84□□□□□ -1.31
DDI1YER143W MST28P39552 234 aa6.84□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YDL186WP48568 277 aa6.84□□□□□ -1.31
DDI1YER143W MST27P53176 234 aa6.84□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YNR034W-AQ3E841 98 aa6.84□□□□□ -1.31
DDI1YER143W HMRA1P0CY11 126 aa6.83□□□□□ -1.32
DDI1YER143W CUP2P15315 225 aa6.83□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YFR045WP43617 309 aa6.83□□□□□ -1.32
DDI1YER143W DAD4P69851 72 aa6.83□□□□□ -1.32
DDI1YER143W GIM5Q04493 163 aa6.83□□□□□ -1.32
DDI1YER143W GEP3Q08622 556 aa6.83□□□□□ -1.32
DDI1YER143W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W UTR5P32630 166 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W PAM17P36147 197 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W SUR2P38992 349 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W AGE2P40529 298 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W TRI1Q05024 226 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W IZH3Q07959 543 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YLR342W-AQ3E810 57 aa6.82□□□□□ -1.32
DDI1YER143W DAD2P36162 133 aa6.81□□□□□ -1.32
DDI1YER143W PRE5P40302 234 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
DDI1YER143W DAD1Q12248 94 aa6.81□□□□□ -1.32
DDI1YER143W PRM7Q12459 698 aa6.81□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa6.81□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YGR035W-AQ45U48 73 aa6.81□□□□□ -1.32
DDI1YER143W POR1P04840 283 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YKL102CP34249 101 aa6.8□□□□□ -1.32
DDI1YER143W SIM1P40472 476 aa6.8□□□□□ -1.32
DDI1YER143W TDA4P47153 279 aa6.8□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YIP3P53633 176 aa6.8□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YOR011W-AQ3E807 68 aa6.8□□□□□ -1.32
DDI1YER143W CPT1P17898 393 aa6.79□□□□□ -1.32
DDI1YER143W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
DDI1YER143W ATG33Q06485 197 aa6.79□□□□□ -1.32
DDI1YER143W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YHR022CP38763 256 aa6.78□□□□□ -1.32
DDI1YER143W IRC22P40006 225 aa6.78□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YGR149WP48236 432 aa6.78□□□□□ -1.32
DDI1YER143W ARL3Q02804 198 aa6.78□□□□□ -1.32
DDI1YER143W CCW12Q12127 133 aa6.78□□□□□ -1.32
DDI1YER143W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa6.78□□□□□ -1.32
DDI1YER143W RPB11P38902 120 aa6.77□□□□□ -1.33
DDI1YER143W MIC26P50087 233 aa6.77□□□□□ -1.33
DDI1YER143W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
DDI1YER143W RRG8Q06109 277 aa6.77□□□□□ -1.33
DDI1YER143W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
DDI1YER143W RPL12BP0CX54 165 aa6.76□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YBR144CP34215 104 aa6.76□□□□□ -1.33
DDI1YER143W MRPL28P36527 147 aa6.76□□□□□ -1.33
DDI1YER143W CYT2Q00873 224 aa6.76□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YMR244WQ04018 355 aa6.76□□□□□ -1.33
DDI1YER143W MPC2P38857 129 aa6.75□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YER135CP40082 130 aa6.75□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YJR096WP47137 282 aa6.75□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YPL162CQ12042 273 aa6.75□□□□□ -1.33
DDI1YER143W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YOL085CQ99345 113 aa6.75□□□□□ -1.33
DDI1YER143W MDM10P18409 493 aa6.74□□□□□ -1.33
DDI1YER143W MRPS8Q03799 155 aa6.74□□□□□ -1.33
DDI1YER143W UPS3Q04006 179 aa6.74□□□□□ -1.33
DDI1YER143W ECM33P38248 429 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W PAU7P39545 55 aa6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W MIG3P39943 394 aa6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W DXO1Q06349 442 aa6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W YPR063CQ12160 140 aa6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W TIM22Q12328 207 aa6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W CMC2Q3E7A4 109 aa6.73□□□□□ -1.33
DDI1YER143W VAR1P02381 398 aa6.72□□□□□ -1.33
DDI1YER143W SEC4P07560 215 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
DDI1YER143W SDH8P38345 138 aa6.72□□□□□ -1.33
DDI1YER143W COX16P47081 118 aa6.72□□□□□ -1.33
DDI1YER143W SDS23P53172 527 aa6.72□□□□□ -1.33
DDI1YER143W ALG13P53178 202 aa6.72□□□□□ -1.33
DDI1YER143W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W VMA16P23968 213 aa6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W AGA1P32323 725 aa6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YFR035CP43608 114 aa6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W THG1P53215 237 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W CSM4Q08955 156 aa6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
DDI1YER143W ZRT1P32804 376 aa6.7□□□□□ -1.34
DDI1YER143W SSS1P35179 80 aa6.7□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YDR274CP87283 123 aa6.7□□□□□ -1.34
DDI1YER143W GPI19Q04082 140 aa6.7□□□□□ -1.34
DDI1YER143W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
DDI1YER143W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YGR017WP53210 297 aa6.69□□□□□ -1.34
DDI1YER143W VPS71Q03433 280 aa6.69□□□□□ -1.34
DDI1YER143W GTO3Q04806 366 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.9 ms