RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	RPO31	P04051	1460 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	INO4	P13902	151 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	FYV5	P25585	152 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	TDA2	P40045	126 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YMR082C	Q04276	118 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	FIT3	Q08907	204 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YPR013C	Q12145	317 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	ATG40	Q99325	256 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MSB2	P32334	1306 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YEL045C	P32616	141 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	ERV14	P53173	138 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YML079W	Q03629	201 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	GPI19	Q04082	140 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YOS1	Q3E834	85 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MYO1	P08964	1928 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	HMRA1	P0CY11	126 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YGL010W	P25338	174 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	GTT1	P40582	234 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YCL001W-A	P87012	153 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YPR195C	Q06594	109 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	RIF1	P29539	1916 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MRPL44	P19956	98 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	SRB6	P32570	121 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YGR269W	P40326	108 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YFL012W	P43580	148 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	CIS3	P47001	227 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YDR029W	Q12111	104 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	TIR3	P40552	269 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	HUR1	P45820	110 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YGL260W	P53056	76 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	BOL2	P53082	120 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MIX14	Q04341	121 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YRF1-2	P40105	1681 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	PEP8	P40335	379 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YPI1	P43587	155 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	IGO1	P53897	168 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YPR153W	Q06537	140 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	COA6	Q3E846	104 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	LAA1	P39526	2014 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	PAU21	P0CE86	164 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	PAU22	P0CE87	164 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YER187W	P40102	141 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	BRP1	P53194	125 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YPL067C	Q02754	198 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	GPI11	Q06636	219 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YDL157C	Q12082	118 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	GSC2	P40989	1895 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	ECM12	O13529	151 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YBR209W	P38311	105 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YDR114C	Q04597	100 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	ELP6	Q04868	273 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	MDM35	O60200	86 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	COX8	P04039	78 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.8	□□□□□ -1.96	not detected
SLX8	YER116C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	EMC5	P40540	141 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	DCV1	P43595	202 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	SEN15	Q04675	128 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	HRT1	Q08273	121 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	FMT1	P32785	401 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	UTH1	P36135	365 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YKR045C	P36138	183 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	HSP10	P38910	106 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YER084W	P40057	128 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	VMA21	P41806	77 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	NAT5	Q08689	176 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	ESP1	Q03018	1630 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YPK9	Q12697	1472 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	SEC11	P15367	167 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	STF2	P16965	84 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	PAU12	P53343	120 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	YLR296W	Q05898	108 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	FIT2	Q08906	153 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	DAD1	Q12248	94 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SLX8	YER116C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	FUN14	P18411	198 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	HPA3	P39979	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97

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