RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YHR173CP38864 112 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MBB1P39534 108 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MST28P39552 234 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CYB5P40312 120 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HUA1P40325 198 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YIL163CP40448 117 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C POG1P40473 351 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PHS1P40857 217 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C GPI2P46961 280 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HIT1P46973 164 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C AIM24P47127 394 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TDA4P47153 279 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MST27P53176 234 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YGR025WP53216 100 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TOM7P53507 60 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YIP3P53633 176 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C FYV6P53913 173 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SNO1Q03144 224 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RAV2Q03956 351 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YMR253CQ04835 414 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YOL160WQ08321 113 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YOR011W-AQ3E807 68 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PCC1Q3E833 88 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TAR1Q8TGM6 124 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TRA1P38811 3744 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HTB2P02294 131 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CNB1P25296 175 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C NTF2P33331 125 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MID2P36027 376 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MRPS9P38120 278 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YBR090CP38253 122 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MPC2P38857 129 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HAM1P47119 197 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C BNS1P50084 137 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ALG13P53178 202 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DAD3P69850 94 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YDR274CP87283 123 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C VPS71Q03433 280 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YPL162CQ12042 273 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PRM7Q12459 698 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C URA2P07259 2214 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C FMP49A0A023PZB3 126 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C ADH3P07246 375 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C POF1P25576 258 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SRP21P32342 167 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SDH4P37298 181 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL32P38061 130 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C AME1P38313 324 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YHR022CP38763 256 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MIG3P39943 394 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YER135CP40082 130 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YMR141CP40211 102 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C VMA21P41806 77 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MIC26P50087 233 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C TIM21P53220 239 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DAD4P69851 72 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YMR244WQ04018 355 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C NAT3Q06504 195 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YOR105WQ08504 108 aa1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C TIR1P10863 254 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C CPT1P17898 393 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C QRI5P32344 111 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C FZF1P32805 299 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data1.64□□□□□ -2.15not detected
GCN4YEL009C HSP10P38910 106 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SRP14P38985 146 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SPI1P40092 148 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PGD1P40356 397 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YFL067WP43537 175 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YFR045WP43617 309 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MGA1P53050 456 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YGL185CP53100 379 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C HHO1P53551 258 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C ATP19P81451 68 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MRPS8Q03799 155 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MSC3Q05812 728 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C CCW12Q12127 133 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DAD1Q12248 94 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C UTP23Q12339 254 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YLR118CQ12354 227 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DCN1Q12395 269 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YLR342W-AQ3E810 57 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCL001W-BQ96VH2 84 aa1.64□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL12BP0CX54 165 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YGL010WP25338 174 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCR007CP25354 239 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU15P40585 124 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YFR035CP43608 114 aa1.63□□□□□ -2.15
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