RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MON1A	Q86VX9	555 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	WBP1	Q96G27	269 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NOTCH2	Q04721	2471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	FLRT2	O43155	660 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CILP	O75339	1184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NFATC1	O95644	943 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CER1	O95813	267 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	F11	P03951	625 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF883	P0CG24	379 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	GABRG2	P18507	467 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	RHD	Q02161	417 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP4	Q13107	963 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	GAB4	Q2WGN9	574 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CDT1	Q9H211	546 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL17B	Q9UHF5	180 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337		M0R2N6	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TNFSF14	O43557	240 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFS2	O75306	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRT10	P13645	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MATK	P42679	507 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NAMPT	P43490	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC6A11	P48066	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	POTED	Q86YR6	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	NID2	Q14112	1375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GTW7	788 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYMK	A6NI61	221 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	KAT7	O95251	611 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	APOD	P05090	189 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CKM	P06732	381 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	EFNA5	P52803	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLDN6	P56747	220 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTPRN	Q16849	979 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	HLA-B	Q31612	363 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPTAN1-231	ENST00000636337	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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