RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.86	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ASTN1	O14525	1302 aa		11.86	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NSL1	Q96IY1	281 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KLK14	Q9P0G3	267 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CCL15	Q16663	113 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KLHL2	O95198	593 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	DLG4	P78352	724 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CD302	Q8IX05	232 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PYGM	P11217	842 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NCAM1	P13591	858 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SCTR	P47872	440 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.85	□□□□□ -0.51	1e-6	■□□□□ 8.7
AKAP9-216	ENST00000619023	PCSK7	Q16549	785 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	LCA5	Q86VQ0	697 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MEIS2	O14770	477 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PFDN1	O60925	122 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ANP32D	O95626	131 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ATIC	P31939	592 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNA1	Q09470	495 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FUT2	Q10981	343 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TRADD	Q15628	312 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	POLI	Q9UNA4	740 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	HMBS	P08397	361 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP2C8	P10632	490 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MCL1	Q07820	350 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ECM1	Q16610	540 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	EGFL8	Q99944	293 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PSMD10	O75832	226 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TGFB2	P61812	414 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.84	□□□□□ -0.51

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