RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC18A2Q05940 514 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 LPCAT4Q643R3 524 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 FBXO27Q8NI29 283 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 LMO3Q8TAP4 145 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ANO3Q9BYT9 981 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 DMAC2Q9NW81 257 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MYH11P35749 1972 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 POTEB3A0JP26 581 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC160A6NGH7 325 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 H3BNX3 289 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TGFB1I1O43294 461 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SERPINA6P08185 405 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PMLP29590 882 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PHBP35232 272 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ALDH3B2P48448 385 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 HDAC4P56524 1084 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TGFB2P61812 414 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 HTRA3P83110 453 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 NCOA4Q13772 614 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MYBPC2Q14324 1141 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 POTEHQ6S545 545 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 POTEBQ6S5H4 581 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 RFX8Q6ZV50 586 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 LZTR1Q8N653 840 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 APOPT1Q96IL0 206 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MBOAT7Q96N66 472 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 REEP2Q9BRK0 252 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 HAUS8Q9BT25 410 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TCHPQ9BT92 498 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 KLC2Q9H0B6 622 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 HESX1Q9UBX0 185 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CROTQ9UKG9 612 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SQORQ9Y6N5 450 aa11.87□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ATP2A1O14983 1001 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ITM2AO43736 263 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 STARD3NLO95772 234 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CAPNS1P04632 268 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF23P17027 643 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CPA2P48052 419 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 NOVP48745 357 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 COG7P83436 770 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MYBPC1Q00872 1141 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 KCNC4Q03721 635 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CHRNDQ07001 517 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TRIP10Q15642 601 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC153Q494R4 210 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC5A5Q92911 643 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ARMCX1Q9P291 453 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 MYPNQ86TC9 1320 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 SOBPA7XYQ1 873 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TXNDC9O14530 226 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PMM2O15305 246 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 BAIAP3O94812 1187 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TSPY3P0CV98 308 aa11.86□□□□□ -0.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TSPY8P0CW00 308 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms