RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601252.1

TIMM50-215, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, human

TSL 5

Gene TIMM50, Length 1,737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM50-215	ENST00000601252	CCL14	Q16627	93 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	C2CD6	Q53TS8	623 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TFAP2B	Q92481	460 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	KIF12	Q96FN5	646 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	HPDL	Q96IR7	371 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TRIM7	Q9C029	511 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	PPCS	Q9HAB8	311 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	GJD2	Q9UKL4	321 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TLDC2	A0PJX2	215 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TRIM66	O15016	1216 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SHBG	P04278	402 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	RALA	P11233	206 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	GNAT1	P11488	350 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CD19	P15391	556 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	FGFR4	P22455	802 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	RAP1GAP	P47736	663 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	KCNJ1	P48048	391 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ERICH1	Q86X53	443 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	RAPGEF5	Q92565	580 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CABS1	Q96KC9	395 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SNX27	Q96L92	541 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TTC25	Q96NG3	672 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	OSMR	Q99650	979 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SDCBP2	Q9H190	292 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		15	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	KPNA6	O60684	536 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	FSBP	O95073	299 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TTC4	O95801	387 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	MYL3	P08590	195 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	HOXC8	P31273	242 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SEC24C	P53992	1094 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	MYO1E	Q12965	1108 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	NR1H3	Q13133	447 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CCDC25	Q86WR0	208 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CHST7	Q9NS84	486 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	GINS2	Q9Y248	185 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ABHD2	P08910	425 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	VDR	P11473	427 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ITGA8	P53708	1063 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CRHR2	Q13324	411 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SNX1	Q13596	522 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	STAT4	Q14765	748 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TTC13	Q8NBP0	860 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	MIS12	Q9H081	205 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	KRT7	P08729	469 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	CHN1	P15882	459 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ACAP1	Q15027	740 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	SNX17	Q15036	470 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	STIL	Q15468	1287 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TIMM50-215	ENST00000601252	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		14.97	□□□□□ -0.01

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