RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590740.2

AC060780.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC060780.1, Length 5,084 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC060780.1-202ENST00000590740 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HPCAP84074 193 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CCDC142Q17RM4 750 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 EPC2Q52LR7 807 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 UBA3Q8TBC4 463 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 APOL5Q9BWW9 433 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 NAGPAQ9UK23 515 aa8.46□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 TOMM70O94826 608 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 PGK2P07205 417 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ATP6V1B1P15313 513 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 SGO1Q5FBB7 561 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HES6Q96HZ4 224 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 VPS50Q96JG6 964 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 THAP2Q9H0W7 228 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HEATR9A2RTY3 570 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 PSTPIP1O43586 416 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 GLRA3O75311 464 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 GUCA1CO95843 209 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CTSHP09668 335 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ITGA4P13612 1032 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 DSG1Q02413 1049 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CCNJLQ8IV13 435 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HPDLQ96IR7 371 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CNBD2Q96M20 576 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 RNF181Q9P0P0 153 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 V9GYQ6 96 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 KRT75O95678 551 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 NCAM1P13591 858 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 EPHB2P29323 1055 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 NUP107P57740 925 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 WDR93Q6P2C0 686 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CHSY1Q86X52 802 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 SGF29Q96ES7 293 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 BBS2Q9BXC9 721 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HEY2Q9UBP5 337 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 REREQ9P2R6 1566 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 E7ENQ6 273 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 RPS6KA5O75582 802 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 USP1O94782 785 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 THRAP10827 490 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 TCF3P15923 654 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 TGM2P21980 687 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 MUTP22033 750 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 OVGP1Q12889 678 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 FAR2Q96K12 515 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 STMN3Q9NZ72 180 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 SOX13Q9UN79 622 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 AP4S1Q9Y587 144 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.45□□□□□ -1.06
AC060780.1-202ENST00000590740 HBP1O60381 514 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms