RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 ABHD2P08910 425 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 STAT4Q14765 748 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 EMC1Q8N766 993 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 TMEM120BA0PK00 339 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 IFNAR2P48551 515 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 CCNA1P78396 465 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 KYAT1Q16773 422 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 ILDR2Q71H61 639 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 HPDLQ96IR7 371 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD4-202ENST00000569223 FOXO6A8MYZ6 492 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 M0QYV0 167 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 P4HA1P13674 534 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 GABRB2P47870 512 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 MORF4L2Q15014 288 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CYP4X1Q8N118 509 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 FBXO41Q8TF61 875 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CCDC77Q9BR77 488 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 KDELR1P24390 212 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PLCB3Q01970 1234 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 TAZQ16635 292 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 NLRP7Q8WX94 980 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 KATNBL1Q9H079 304 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CITO14578 2027 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 SGK1O00141 431 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 TSPAN1O60635 241 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CDH16O75309 829 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 VDRP11473 427 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 GPD2P43304 727 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PSMC4P43686 418 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 DYNLT1P63172 113 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 KAT2BQ92831 832 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 SPON1Q9HCB6 807 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 EURLQ9NYK6 297 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 HMGCRP04035 888 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CCDC142Q17RM4 750 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 BBS12Q6ZW61 710 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 ACTL9Q8TC94 416 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 MGARPQ8TDB4 240 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CST8O60676 142 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 LRRC14Q15048 493 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 TTC25Q96NG3 672 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 DPP3Q9NY33 737 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 TBK1Q9UHD2 729 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 C2CD2Q9Y426 696 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 IFNB1P01574 187 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 INCA1Q0VD86 236 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 ACAP3Q96P50 834 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 KCNK9Q9NPC2 374 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 H3BRB1 525 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 PDHXO00330 501 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 NDC80O14777 642 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 CD48P09326 243 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 BRAFP15056 766 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 MIPP30301 263 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 NDST1P52848 882 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 RBP5P82980 135 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 MYO1EQ12965 1108 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD4-202ENST00000569223 TTC13Q8NBP0 860 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms