RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 BEST2Q8NFU1 509 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 DCLK3Q9C098 648 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 E5RJQ4 531 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ECEL1O95672 775 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CYBAP13498 195 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CDC42EP1Q00587 391 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 INCA1Q0VD86 236 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 LRRD1A4D1F6 860 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FGFR1P11362 822 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TM4SF4P48230 202 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 DYNLT1P63172 113 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PMF1Q6P1K2 205 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CD302Q8IX05 232 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PWWP2AQ96N64 755 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CNTN3Q9P232 1028 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 Q9Y3F1 56 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 LRCH4O75427 683 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FCGRTP55899 365 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC25Q86WR0 208 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TTC30AQ86WT1 665 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 EXD1Q8NHP7 514 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 LPPQ93052 612 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CD48P09326 243 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ODF2Q5BJF6 829 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TRNP1Q6NT89 227 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 A8MXQ7 604 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 H0YGN5 161 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 HMGCRP04035 888 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CDO1Q16878 200 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 NFS1Q9Y697 457 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PODXLO00592 558 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 OPA1O60313 960 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC130P13994 396 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MAN1A1P33908 653 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 FNTAP49354 379 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC45Q96CN5 670 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TP73O15350 636 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RARBP10826 455 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GNAT1P11488 350 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ADORA2BP29275 332 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MIS12Q9H081 205 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GABBR2O75899 941 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 CHRNA1P02708 482 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SHBGP04278 402 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GJA9P57773 515 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RNF186Q9NXI6 227 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 KPNA7A9QM74 516 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ETS1P14921 441 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 HOXC8P31273 242 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ATP1A2P50993 1020 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 IRF5Q13568 498 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 HSPH1Q92598 858 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 EXOC4Q96A65 974 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.06■■□□□ 1.12
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