RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 GPC5P78333 572 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SLC18A3Q16572 532 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SLC47A2Q86VL8 602 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 VPS52Q8N1B4 723 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 UBA3Q8TBC4 463 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 BAP1Q92560 729 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 C18orf8Q96DM3 657 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 IGSF21Q96ID5 467 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CHP1Q99653 195 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ACBD6Q9BR61 282 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM62Q9BVG3 475 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ESPNB1AK53 854 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TNNT1P13805 278 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PRKCIP41743 596 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ASPAP45381 313 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SLC39A12Q504Y0 691 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SYCE1Q8N0S2 351 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PLVAPQ9BX97 442 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 LCMT1Q9UIC8 334 aa6□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 FAM170AA1A519 330 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MYO1FO00160 1098 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SPOPO43791 374 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RB1P06400 928 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ADH1AP07327 375 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 COL9A1P20849 921 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CASQ1P31415 396 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 VAV2P52735 878 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 LMO3Q8TAP4 145 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RNF139Q8WU17 664 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 BCO2Q9BYV7 579 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PIDD1Q9HB75 910 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CACNG4Q9UBN1 327 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RNF8O76064 485 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 LRG1P02750 347 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MMEP08473 750 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 GZMAP12544 262 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 BMPR1AP36894 532 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PBX3P40426 434 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RGS7P49802 495 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TAP1Q03518 808 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PLD1Q13393 1074 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 GPM6BQ13491 265 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC181Q5TID7 509 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 KRT82Q9NSB4 513 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 H0YGN5 161 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 FGF18O76093 207 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MICAL2O94851 1124 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 LCP1P13796 627 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 OR1D2P34982 312 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 EPHB3P54753 998 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 DSC1Q08554 894 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SHHQ15465 462 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 NAB2Q15742 525 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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