RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	MYOT	Q9UBF9	498 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	AKT3	Q9Y243	479 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		3.21	□□□□□ -1.89
MRPL48-208	ENST00000537007	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007		A0A087X0B3	334 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007		A0A1W2PQU0	124 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007		H7BY64	318 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CBFA2T2	O43439	604 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LRP3	O75074	770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ENTPD3	O75355	529 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CABYR	O75952	493 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MMP1	P03956	469 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	RET	P07949	1114 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	FCER1A	P12319	257 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PTGS1	P23219	599 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SOX5	P35711	763 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	STAT3	P40763	770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SCRN1	Q12765	414 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNAB2	Q13303	367 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PICALM	Q13492	652 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	UBE4A	Q14139	1066 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	STPG1	Q5TH74	334 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF627	Q7L945	461 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	DIO2	Q92813	273 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	FGD4	Q96M96	766 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	YME1L1	Q96TA2	773 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	IER2	Q9BTL4	223 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SIL1	Q9H173	461 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	S1PR5	Q9H228	398 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	POMK	Q9H5K3	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	RAB23	Q9ULC3	237 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CA14	Q9ULX7	337 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	APC2	O95996	2303 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SIPA1L1	O43166	1804 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TSC2	P49815	1807 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ASTN1	O14525	1302 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LAMA1	P25391	3075 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ALG1L2	C9J202	215 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PER2	O15055	1255 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NBN	O60934	754 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNH1	O95259	989 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LRG1	P02750	347 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CKM	P06732	381 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	EPHX1	P07099	455 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	GP1BB	P13224	206 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	DNAJB1	P25685	340 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ADRA1B	P35368	520 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	C21orf58	P58505	322 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	BFSP2	Q13515	415 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TDG	Q13569	410 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PLS1	Q14651	629 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms