RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CKMP06732 381 aa11.07□□□□□ -0.64
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN6P56747 220 aa11.07□□□□□ -0.64
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTRK3Q16288 839 aa11.07□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EOGTQ5NDL2 527 aa11.07□□□□□ -0.64
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAREM1Q9H706 876 aa11.07□□□□□ -0.64
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 15.5
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFNA5P52803 228 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCRN1Q12765 414 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PADI6Q6TGC4 694 aa11.04□□□□□ -0.64
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAP1Q92560 729 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT74Q96LB3 600 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNKPQ96T60 521 aa11.04□□□□□ -0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.04□□□□□ -0.64
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