RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 BTBD19C9JJ37 291 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPM1DO15297 605 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLSTN1O94985 981 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL1R2P27930 398 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGAP25P42331 645 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MASP1P48740 699 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP4F2P78329 520 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNAPC2Q13487 334 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TREML2Q5T2D2 321 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LVRNQ6Q4G3 990 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SHC4Q6S5L8 630 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 C3orf20Q8ND61 904 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADAMTS15Q8TE58 950 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 JADE3Q92613 823 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAB24Q969Q5 203 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RITA1Q96K30 269 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 DMRTA2Q96SC8 542 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTDSS2Q9BVG9 487 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMOC2Q9H3U7 446 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERHLQ9NQF3 203 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MCM8Q9UJA3 840 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 GABRQQ9UN88 632 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRKAB1Q9Y478 270 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLHL33A6NCF5 533 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC154A6NI56 674 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 DTNBO60941 627 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHKG2P15735 406 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ENGP17813 658 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 C5AR1P21730 350 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNGA1P29973 690 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRDX5P30044 214 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LIPAP38571 399 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 THBS3P49746 956 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE1AP54750 535 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADKP55263 362 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPSM2P81274 684 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 GHRHRQ02643 423 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 INAVAQ3KP66 663 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q4G0T1 1027 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 C10orf25Q5T742 122 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 VPS53Q5VIR6 699 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANO7Q6IWH7 933 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PGM2L1Q6PCE3 622 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIRREL2Q6UWL6 708 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 NAPRTQ6XQN6 538 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 DEF8Q6ZN54 512 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZWC4 215 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP37Q86T82 979 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM90A1Q86YD7 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATL2Q8NHH9 583 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBXO41Q8TF61 875 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 COA7Q96BR5 231 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTMR4Q9NYA4 1195 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHLDB1Q86UU1 1377 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM232C9JQI7 657 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF8O76064 485 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIF20AO95235 890 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 EDNRBP24530 442 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PXNP49023 591 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLCN2P51788 898 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC00205P59089 165 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL10RAQ13651 578 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 E2F2Q14209 437 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEMA3AQ14563 771 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACAP2Q15057 778 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRC41Q15345 812 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 NPY5RQ15761 445 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 C3orf36Q3SXR2 165 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LONRF3Q496Y0 759 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TERB1Q8NA31 727 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 COG1Q8WTW3 980 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 HESX1Q9UBX0 185 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 M0QYG6 137 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 A1BGP04217 495 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHRM3P20309 590 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRPAP1P30533 357 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 VIPR2P41587 438 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms