RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYT15Q9BQS2 421 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCANO14594 1321 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GFRA3O60609 400 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOL4O94818 638 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF202O95125 648 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TARSP26639 723 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP4F8P98187 520 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPYDQ12882 1025 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VSTM1Q6UX27 236 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CMTM8Q8IZV2 173 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FSIP1Q8NA03 581 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC34Q96HJ3 373 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC3BQ96PB8 259 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNX25Q9H3E2 840 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VRTNQ9H8Y1 702 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP34Q70CQ2 3546 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC38A8A6NNN8 435 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HCRTO43612 131 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHACTR2O75167 634 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP2C2O75185 946 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NR3C1P04150 777 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDGFRBP09619 1106 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR15P49685 360 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYL6P60660 151 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNNC1P63316 161 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLCB2Q00722 1185 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNB1Q14721 858 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAMSTRQ6ZN01 415 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MON1AQ86VX9 555 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHO2Q8TD55 490 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMC2Q8TDI7 906 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BPIFB1Q8TDL5 484 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM3CQ92520 227 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA17Q96L03 361 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XYLT2Q9H1B5 865 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRTAC1Q9NQ79 661 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIA3Q5JRA6 1907 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IKBKBO14920 756 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK13O15264 365 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAMEF12O95522 483 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SP9P0CG40 484 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AVPR1AP37288 418 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASP4P49662 377 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUCB2P80303 420 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFIL3Q16649 462 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF528Q3MIS6 628 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SDHAF4Q5VUM1 108 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR6B3Q8NGW1 331 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR23AA6NEV1 266 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAMTOR5O43504 91 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR29P0C7W0 189 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BIRC3Q13489 604 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC142Q17RM4 750 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASCL5Q7RTU5 278 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCN4BQ8IWT1 228 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAB21L3Q8N8X9 362 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYLPFQ96A32 169 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCED1BQ96HM7 432 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IER2Q9BTL4 223 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TDP1Q9NUW8 608 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EHD2Q9NZN4 543 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL4A3Q01955 1670 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms