RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 TNK2Q07912 1038 aa26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC142Q17RM4 750 aa26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 DCLK2Q8N568 766 aa26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF292O60281 2723 aa26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SOBPA7XYQ1 873 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TGFB1I1O43294 461 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 NOL4O94818 638 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 EHHADHQ08426 723 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TXNDC8Q6A555 127 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SYT15Q9BQS2 421 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.43■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TADA3O75528 432 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 DLATP10515 647 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CASP1P29466 404 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CXCL12P48061 93 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CYP2J2P51589 502 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 FOXK2Q01167 660 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SATB1Q01826 763 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 GAS6Q14393 721 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PON2Q15165 354 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ATL3Q6DD88 541 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 HS2ST1Q7LGA3 356 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 RDH13Q8NBN7 331 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 FNBP1Q96RU3 617 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CGRRF1Q99675 332 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TDP1Q9NUW8 608 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CDH9Q9ULB4 789 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CCL26Q9Y258 94 aa26.42■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CLIC2O15247 247 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TNNI1P19237 187 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PSMD6Q15008 389 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 WDR44Q5JSH3 913 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 RESP18Q5W5W9 173 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 FAM171BQ6P995 826 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 Q6ZS52 159 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MON1AQ86VX9 555 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SCN4BQ8IWT1 228 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 XXYLT1Q8NBI6 393 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MYRFLQ96LU7 910 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CFAP45Q9UL16 551 aa26.41■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 WARSP23381 471 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEA11P43364 429 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CYP24A1Q07973 514 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 BMT2Q1RMZ1 405 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ERMP1Q7Z2K6 904 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MYLPFQ96A32 169 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MMS19Q96T76 1030 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 GKN1Q9NS71 199 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 DCHS1Q96JQ0 3298 aa26.4■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ATP2C2O75185 946 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 AFMP43652 599 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PKP1Q13835 747 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CCINQ13939 588 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC127Q96BQ5 260 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 FAM83CQ9BQN1 747 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC7Q9HCX4 862 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-203ENST00000511412 PTPRDP23468 1912 aa26.39■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 LMO2P25791 158 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CUL4BQ13620 913 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 RUNX3Q13761 415 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 RMDN1Q96DB5 314 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 EBF3Q9H4W6 596 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 HPS4Q9NQG7 708 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 FRYLO94915 3013 aa26.38■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GREB1Q4ZG55 1949 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CYP27A1Q02318 531 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms