RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CHST7Q9NS84 486 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HES2Q9Y543 173 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 H0YGN5 161 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TCF4P15884 667 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CETN2P41208 172 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PLTPP55058 493 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 COPS2P61201 443 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PDCLQ13371 301 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MTFR1Q15390 333 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 STILQ15468 1287 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CCNG2Q16589 344 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TRPV1Q8NER1 839 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ARL8AQ96BM9 186 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ARMC5Q96C12 935 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF333Q96JL9 665 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RNF208Q9H0X6 261 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NFS1Q9Y697 457 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PPEF2O14830 753 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KPNA6O60684 536 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ABCB7O75027 752 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ERBB2P04626 1255 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN7P35236 360 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GJC1P36383 396 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRT17Q04695 432 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R7Q15435 360 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 XKR4Q5GH76 650 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 UBXN11Q5T124 520 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf31Q8N865 590 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ART4Q93070 314 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MYADML2A6NDP7 307 aa8.64□□□□□ -1.03
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PDE4D-208ENST00000502484 SEPT4O43236 478 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CCL5P13501 91 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KCNE1P15382 129 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CYP3A5P20815 502 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PSMA2P25787 234 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GJA9P57773 515 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SNX1Q13596 522 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PTK6Q13882 451 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATL2Q8NHH9 583 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PDE4D-208ENST00000502484 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PDE4D-208ENST00000502484 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PIRO00625 290 aa8.63□□□□□ -1.03
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PDE4D-208ENST00000502484 CD4P01730 458 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRT1P04264 644 aa8.63□□□□□ -1.03
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PDE4D-208ENST00000502484 LMAN1P49257 510 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ACAP1Q15027 740 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 UNC93AQ86WB7 457 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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