RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493427.1

ABCD4-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-215	ENST00000493427	BNC1	Q01954	994 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	NR5A1	Q13285	461 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GJA10	Q969M2	543 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	RIT2	Q99578	217 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SVIL	O95425	2214 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC37A4	O43826	429 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	PSMD10	O75832	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ERLIN2	O94905	339 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	KRT2	P35908	639 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GRK6	P43250	576 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	FOSB	P53539	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427		A0A1B0GTW7	788 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TSPAN1	O60635	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GAS7	O60861	476 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	RFPL3	O75679	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427		A1L4Q6	167 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CBX4	O00257	560 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	B3GAT3	O94766	335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GABRR2	P28476	465 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	BRCC3	P46736	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	POTED	Q86YR6	584 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	PDZD2	O15018	2839 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	WNT7A	O00755	349 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	PTGES	O14684	152 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	RECQL4	O94761	1208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	WEE1	P30291	646 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TIE1	P35590	1138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	TRIM29	Q14134	588 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	HAS1	Q92839	578 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	EXTL1	Q92935	676 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-215	ENST00000493427	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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