RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809		E9PCH4	1651 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	USP19	O94966	1318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	BTN3A1	O00481	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	DCLK1	O15075	740 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MGEA5	O60502	916 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FSHB	P01225	129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	GRP	P07492	148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PEX2	P28328	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC7A1	P30825	629 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NPTX2	P47972	431 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NDUFV1	P49821	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	INHBC	P55103	352 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TBX4	P57082	545 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LOXL3	P58215	753 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	KLF10	Q13118	480 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NELL2	Q99435	816 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CUL7	Q14999	1698 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809		A0A0B4J269	797 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TRIAP1	O43715	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CAND2	O75155	1236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ESRRB	O95718	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ITGAL	P20701	1170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SEC24C	P53992	1094 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FMO1	Q01740	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CTBP1	Q13363	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TUBB3	Q13509	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	RAB32	Q13637	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	IQCB1	Q15051	598 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PTPRR	Q15256	657 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CNGA2	Q16280	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809		Q96MF0	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NES	P48681	1621 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	KDM5C	P41229	1560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MPPED1	O15442	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PRC1	O43663	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLPI	P03973	132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TYRP1	P17643	537 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MPL	P40238	635 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FOLR3	P41439	243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF134	P52741	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	UCP3	P55916	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NXPH1	P58417	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ITIH3	Q06033	890 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MPP3	Q13368	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809		Q6ZNX1	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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