RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476615.1

TTL-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

TSL 3

Gene TTL, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-203ENST00000476615 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.98□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.98□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.98□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 SCN1AP35498 2009 aa9.98□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 CFAP54Q96N23 3096 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 SPTLC2O15270 562 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 CLDN3O15551 220 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 URODP06132 367 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 GAP43P17677 238 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 CYP3A5P20815 502 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 PAX3P23760 479 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 LRPAP1P30533 357 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 MTHFRP42898 656 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 ZNF165P49910 485 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 STRN3Q13033 797 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 CLUL1Q15846 466 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 RTP2Q5QGT7 225 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 HSCBQ8IWL3 235 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 PLD4Q96BZ4 506 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 ACAP3Q96P50 834 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 TTPALQ9BTX7 342 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 APOL6Q9BWW8 343 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 DPP7Q9UHL4 492 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.97□□□□□ -0.81
TTL-203ENST00000476615 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 OGTO15294 1046 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 DCXO43602 365 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CUTAO60888 179 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CILPO75339 1184 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 TADA2AO75478 443 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 16.2
TTL-203ENST00000476615 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ADSSP30520 456 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 HOXA9P31269 272 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CLCNKBP51801 687 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 PKP1Q13835 747 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 PKDCCQ504Y2 493 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SPECC1Q5M775 1068 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CEP135Q66GS9 1140 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SHC4Q6S5L8 630 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CD302Q8IX05 232 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 MYCT1Q8N699 235 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 TNMDQ9H2S6 317 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 MTRRQ9UBK8 725 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 GDAQ9Y2T3 454 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 DERAQ9Y315 318 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.96□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 M0QZQ0 153 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SYN3O14994 580 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 TGM5O43548 720 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ABLIM3O94929 683 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 B3GALT4O96024 378 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 KLRC2P26717 231 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 PCDH1Q08174 1060 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ALCAMQ13740 583 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SEPT6Q14141 434 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 LRRC14Q15048 493 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 UVSSAQ2YD98 709 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 RESP18Q5W5W9 173 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CES5AQ6NT32 575 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 REC114Q7Z4M0 266 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 EDAQ92838 391 aa9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTL-203ENST00000476615 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms