RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 FKBP10Q96AY3 582 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 APOL5Q9BWW9 433 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 KLC4Q9NSK0 619 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 WDR27A2RRH5 827 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 GOLIM4O00461 696 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 FRS3O43559 492 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 FAM193AP78312 1265 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 RAB32Q13637 225 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 TBCCQ15814 346 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 CNGA2Q16280 664 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZG16BQ96DA0 208 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.4□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGCE-210ENST00000472326 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGCE-210ENST00000472326 MYF5P13349 255 aa8.39□□□□□ -1.07
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SGCE-210ENST00000472326 INHBEP58166 350 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 FMO1Q01740 532 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 KRT17Q04695 432 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ICE2Q659A1 982 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 OR56A3Q8NH54 315 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 NELL2Q99435 816 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 TLK1Q9UKI8 766 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.39□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ZAR1LA6NP61 321 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 LINC00473A8K010 186 aa8.38□□□□□ -1.07
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SGCE-210ENST00000472326 NR2F6P10588 404 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 MYO1EQ12965 1108 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SEMA5AQ13591 1074 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PLA1AQ53H76 456 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 MICU3Q86XE3 530 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CAGE1Q8TC20 777 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 RFKQ969G6 155 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 APIPQ96GX9 242 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SUCLG2Q96I99 432 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 C8orf48Q96LL4 319 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.38□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ISM1B1AKI9 464 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CYP2C9P11712 490 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CLCN2P51788 898 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 WNT3P56703 355 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 E2F2Q14209 437 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 MAVSQ7Z434 540 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SESTD1Q86VW0 696 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PBKQ96KB5 322 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 DUSP26Q9BV47 211 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 EHD3Q9NZN3 535 aa8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SUV39H1O43463 412 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ALG8Q9BVK2 526 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 COL20A1Q9P218 1284 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 FAM50BQ9Y247 325 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 INSL6Q9Y581 213 aa8.36□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CSF1RP07333 972 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ADORA2AP29274 412 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 LRPAP1P30533 357 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 LIPAP38571 399 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SATB1Q01826 763 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 STK31Q9BXU1 1019 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 KLK15Q9H2R5 256 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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