RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SMC6Q96SB8 1091 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 NCALDP61601 193 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GALNTL6Q49A17 601 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 FITM2Q8N6M3 262 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SPATA33Q96N06 139 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CPXM1Q96SM3 734 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V1G2O95670 118 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CLCN3P51790 818 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 GAD2Q05329 585 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TFDP1Q14186 410 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 LHX5Q9H2C1 402 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PNMA3Q9UL41 463 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 NDC80O14777 642 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ASMTLO95671 621 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CD48P09326 243 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ2P63252 427 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CCDC142Q17RM4 750 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CSADQ9Y600 493 aa21.51■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 KDELR1P24390 212 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RAD23BP54727 409 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 BNIP1Q12981 228 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC3Q13217 504 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MTM1Q13496 603 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PCGF5Q86SE9 256 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CDT1Q9H211 546 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FZD8Q9H461 694 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SIX4Q9UIU6 781 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 LGR5O75473 907 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ERBB2P04626 1255 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 NFICP08651 508 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MYO1EQ12965 1108 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SPARCL1Q14515 664 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 XYLT1Q86Y38 959 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TTC13Q8NBP0 860 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 KCTD6Q8NC69 237 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SPOCK2Q92563 424 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CA4P22748 312 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 GPX6P59796 221 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MGAT5Q09328 741 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 BBS12Q6ZW61 710 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CPT1BQ92523 772 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 HSPH1Q92598 858 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 COPS5Q92905 334 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 KLHL29Q96CT2 875 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SDCBP2Q9H190 292 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 NOD2Q9HC29 1040 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SENP1Q9P0U3 644 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PPM1 405 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ITGB3P05106 788 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ARL4CP56559 192 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 DPH6Q7L8W6 267 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RFX6Q8HWS3 928 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TWNKQ96RR1 684 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 BCO2Q9BYV7 579 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SOCS7O14512 581 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PIAS1O75925 651 aa21.48■■□□□ 1.03
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