RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 TECTAO75443 2155 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CD58P19256 250 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NDST1P52848 882 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NHLH1Q02575 133 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ADCY1Q08828 1119 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PKMYT1Q99640 499 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CISHQ9NSE2 258 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 MTMR11A4FU01 709 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PRRG1O14668 218 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 HCRTO43612 131 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CILPO75339 1184 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINC1P01008 464 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 MFAP3P55082 362 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 UBXN1Q04323 297 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNMA1Q12791 1236 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ARID3AQ99856 593 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NME7Q9Y5B8 376 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP2C2O75185 946 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ZMYND10O75800 440 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 C8AP07357 584 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ITIH3Q06033 890 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPN21Q16825 1174 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 RRAGAQ7L523 313 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 WHAMMQ8TF30 809 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCB6Q9NP58 842 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NR2E1Q9Y466 385 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGEF1-205ENST00000450873 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC24AO95486 1093 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXA9P31269 272 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 FANCCQ00597 558 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP4Q13115 394 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 ACOT1Q86TX2 421 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 UBR7Q8N806 425 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF214Q8ND24 703 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 PRRX2Q99811 253 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 SIX2Q9NPC8 291 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 PLXNA3P51805 1871 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GTH6 734 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 PAPLNO95428 1278 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 VNN2O95498 520 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 RFX1P22670 979 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 PLD1Q13393 1074 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 CES5AQ6NT32 575 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXL6Q8N531 539 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGEF1-205ENST00000450873 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms