RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCK2	O43639	380 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOAT2	O75908	522 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GFPT2	O94808	682 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	C8A	P07357	584 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAEP	P09466	180 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	VDR	P11473	427 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAT1	P42224	750 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF75D	P51815	510 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARID5A	Q03989	594 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTK2	Q05397	1052 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAM15	Q13444	863 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASP10	Q92851	521 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR88	Q9GZN0	384 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACP6	Q9NPH0	428 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP8B3	O60423	1300 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	REV3L	O60673	3130 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	THAP12	O43422	761 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	VNN2	O95498	520 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNA15	P30679	374 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCN1	P35523	988 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOX5	P35711	763 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRIK1	P39086	918 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALDH1A3	P47895	512 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMC6	Q7Z403	805 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	VSTM4	Q8IW00	320 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	DRC7	Q8IY82	874 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUK	Q8N0W3	1084 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOL5	Q9BWW9	433 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAFF	Q9ULX9	164 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLXNA3	P51805	1871 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RFPL2	O75678	378 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP1G2	O75843	785 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADCY5	O95622	1261 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLP2R	O95838	553 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1R	P00736	705 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRG1	P02750	347 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPM1	P09493	284 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF132	P52740	706 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	JAM2	P57087	298 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	BPIFB4	P59827	614 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TWF1	Q12792	350 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNC3	Q14003	757 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDR2	Q16832	855 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM35A	Q86V20	835 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TFAP2B	Q92481	460 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCB6	Q9NP58	842 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT82	Q9NSB4	513 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	HESX1	Q9UBX0	185 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC53	A6NM62	1247 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED7	O43513	233 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANXA13	P27216	316 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASP14	P31944	242 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FIGN	Q5HY92	759 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR152	Q8TDT2	470 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GIPC2	Q8TF65	315 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCD	Q96DY2	449 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	YIPF1	Q9Y548	306 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCL16	O15467	120 aa		14.51	□□□□□ -0.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms