RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438357.1

RPS6KA3-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA3, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-202ENST00000438357 USP18Q9UMW8 372 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS6KA3-202ENST00000438357 CCL26Q9Y258 94 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS6KA3-202ENST00000438357 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 GABRDO14764 452 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 NOL4O94818 638 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CNR2P34972 360 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FNTBP49356 437 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ASIC1P78348 528 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGAP8P85298 464 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 AMPD2Q01433 879 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 LMNB2Q03252 620 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 RUNX3Q13761 415 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 E2F4Q16254 413 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 LPAL2Q16609 132 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 WDR44Q5JSH3 913 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 LONP2Q86WA8 852 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 IQUBQ8NA54 791 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 DHX58Q96C10 678 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HPDLQ96IR7 371 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 PKMYT1Q99640 499 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CEP250Q9BV73 2442 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 K7ESF4 209 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CUTAO60888 179 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 YEATS4O95619 227 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 DMWDQ09019 674 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 WDR49Q8IV35 697 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MYRFLQ96LU7 910 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 EBF3Q9H4W6 596 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HPS4Q9NQG7 708 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 PTPRJQ12913 1337 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HCRTO43612 131 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 RETP07949 1114 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 USP17L7P0C7H9 530 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HOXD13P35453 343 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MAGEA11P43364 429 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 PDGFRLQ15198 375 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FAM171BQ6P995 826 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FSIP1Q8NA03 581 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 EXOC4Q96A65 974 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MMS19Q96T76 1030 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SYT15Q9BQS2 421 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CDH9Q9ULB4 789 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HRO43593 1189 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ATG13O75143 517 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ATP2C2O75185 946 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TADA3O75528 432 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CKMP06732 381 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TGM1P22735 817 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 HOXA6P31267 233 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 MTF1Q14872 753 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 CCDC142Q17RM4 750 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 SHC4Q6S5L8 630 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 LIMS2Q7Z4I7 341 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 RDH13Q8NBN7 331 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 TTC16Q8NEE8 873 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 FNBP1Q96RU3 617 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 UBE4BO95155 1302 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms