RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANTXR2P58335 489 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX3-2P78367 333 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 PFKPQ01813 784 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRDNQ13061 729 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 WTAPQ15007 396 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP2R5BQ15173 497 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPHA7Q15375 998 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR158Q5T848 1215 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASSF3Q86WH2 238 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIPK4Q8NE63 616 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTMR8Q96EF0 704 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT23Q9C075 422 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL20A1Q9P218 1284 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB1Q9Y576 335 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUC3AQ02505 3323 aa5.09□□□□□ -1.59
RPS3AP54-201ENST00000435535 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPC1 479 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB14A6NK59 587 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF839A8K0R7 811 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLRF2D3W0D1 207 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7ESF4 209 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 N4BP3O15049 544 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTAGE5O15320 804 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRC1O43663 620 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G6O60733 806 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA7AO75326 666 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARIH2O95376 493 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHA8P1O95397 391 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF286BP0CG31 522 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD40P25942 277 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CST5P28325 142 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP2C18P33260 490 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPHB4P54760 987 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERVK-21P61565 698 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 FPGSQ05932 587 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITKQ08881 620 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC32Q14392 662 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRM4Q14833 912 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD1Q15116 288 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHHQ15465 462 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 VASNQ6EMK4 673 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASC1Q6TDU7 716 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEPT14Q6ZU15 432 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK32CQ86UX6 486 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 MICU3Q86XE3 530 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMIPQ8IY22 773 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB123Q8N688 67 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCOA7Q8NI08 942 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL31RAQ8NI17 732 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D5Q92609 795 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGSQ96S52 555 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMNQ9BXJ7 453 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAD2L2Q9UI95 211 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.08□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.07□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRDO14764 452 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms