RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 YME1L1Q96TA2 773 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 OR10A2Q9H208 303 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 Q9UFV3 132 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CACNA1HO95180 2353 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 CSPG5O95196 566 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP8P85298 464 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 Q9Y3F1 56 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SIP14410 1827 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ASB14A6NK59 587 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 E9PSI1 815 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 RB1P06400 928 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 FAM153BP0C7A2 387 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ADORA1P30542 326 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CTNNB1P35222 781 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CPT1AP50416 773 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GABREP78334 506 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 TUBA3CQ13748 450 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 MTERF2Q49AM1 385 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 DCLK2Q8N568 766 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA5Q8NB90 893 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF384Q8TF68 577 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ASB15Q8WXK1 588 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 RTKNQ9BST9 563 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CEP72Q9P209 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 NCDNQ9UBB6 729 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO40Q9UH90 709 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 R4GN57 208 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SCN5AQ14524 2016 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ASTN1O14525 1302 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PRG0 241 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 APAF1O14727 1248 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CIAO1O76071 339 aa7.3□□□□□ -1.24
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