RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 FAXCQ5TGI0 409 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 WDCPQ9H6R7 721 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 CISHQ9NSE2 258 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 AK9Q5TCS8 1911 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 VWA5AO00534 786 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 EPHX2P34913 555 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 AKT1S1Q96B36 256 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINB12Q96P63 405 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 WNT10BO00744 389 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ANGPT2O15123 496 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR182O15218 404 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 CYTH3O43739 400 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ST8SIA6P61647 398 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ERP27Q96DN0 273 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 STK25O00506 426 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TWF1Q12792 350 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ADGRB2O60241 1585 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A087WZ62 844 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A087X0B3 334 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 E2F8A0AVK6 867 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 CPB2Q96IY4 423 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TGFB3P10600 412 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 YAF2Q8IY57 180 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SETSIPP0DME0 302 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MROH9Q5TGP6 573 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MFN1Q8IWA4 741 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS33BQ9H267 617 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ETFBP38117 255 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ICA1LQ8NDH6 482 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PFDN1O60925 122 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PROSCO94903 275 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 FDFT1P37268 417 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SRLQ86TD4 932 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 AKT1P31749 480 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 DDR1Q08345 913 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A5Q92911 643 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 CYB561D2O14569 222 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PDK2Q15119 407 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP3K6O95382 1288 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 YY1P25490 414 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 RAP1GAPP47736 663 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 H3BRB1 525 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A3P11169 496 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 IL10P22301 178 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ALDH1A3P47895 512 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 OPTNQ96CV9 577 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ANXA9O76027 345 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 PYGLP06737 847 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 BCAT1P54687 386 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ICE2Q659A1 982 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00523Q86TU6 105 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 E2F7Q96AV8 911 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms