RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PGBD4Q96DM1 585 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF560Q96MR9 790 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MCEEQ96PE7 176 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DEFB118Q96PH6 123 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RSAD1Q9HA92 442 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GDF3Q9NR23 364 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ST7Q9NRC1 585 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RGS18Q9NS28 235 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 WBP1LQ9NX94 342 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP83Q9Y592 693 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SCINQ9Y6U3 715 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ANK1P16157 1881 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC151A5D8V7 595 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 E5RJQ4 531 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 I3L4J1 428 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DNM1LO00429 736 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLDN5O00501 218 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAP2K7O14733 419 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 INPPL1O15357 1258 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ATP8B1O43520 1251 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 B4GALT3O60512 393 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SASH3O75995 380 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 BEST1O76090 585 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDHD2O94830 711 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 EOMESO95936 686 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SETSIPP0DME0 302 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SKIP12755 728 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SELPP16109 830 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PSMA2P25787 234 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 IL1R2P27930 398 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADORA2BP29275 332 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAN1A1P33908 653 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PTGIRP43119 386 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CDR1P51861 262 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RABGGTBP53611 331 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC6A3Q01959 620 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GUCY2DQ02846 1103 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TAP1Q03518 808 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TUSC3Q13454 348 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 BFSP2Q13515 415 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TAF5Q15542 800 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 UPP1Q16831 310 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAB6CQ53S08 254 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 LRRC38Q5VT99 294 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRNP1Q6NT89 227 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DSTYKQ6XUX3 929 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FUKQ8N0W3 1084 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 STK32AQ8WU08 396 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 C1orf54Q8WWF1 131 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms