RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384161.1

RNU6-48P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 48, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-48P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-48P-201ENST00000384161 GATA3P23771 443 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KLRC1P26715 233 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CD6P30203 668 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ADRA1BP35368 520 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FOLR3P41439 243 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SCAPQ12770 1279 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MPP3Q13368 585 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PICALMQ13492 652 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 E2F2Q14209 437 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PTPRRQ15256 657 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 INSCQ1MX18 579 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ICE2Q659A1 982 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 VWA1Q6PCB0 445 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ASB10Q8WXI3 467 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CAVIN3Q969G5 261 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM136AQ96C01 138 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 Q96MF0 132 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TOR3AQ9H497 397 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SYBUQ9NX95 663 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DCLK1O15075 740 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FOXN1O15353 648 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 YY2O15391 372 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCP110O43303 1012 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TLR5O60602 858 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RAMP2O60895 175 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 GCP02774 474 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MC2RQ01718 297 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KRT17Q04695 432 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 Q6YL49 198 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 Q6ZNX1 250 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DPP9Q86TI2 863 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DTX2Q86UW9 622 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MICU3Q86XE3 530 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 YAF2Q8IY57 180 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MPP5Q8N3R9 675 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SSH3Q8TE77 659 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPSB4Q96A44 273 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ALG8Q9BVK2 526 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TTYH3Q9C0H2 523 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PADI4Q9UM07 663 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KAT6AQ92794 2004 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 APAF1O14727 1248 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 IL18RAPO95256 599 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ONECUT2O95948 504 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PPP3CBP16298 524 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CHRM3P20309 590 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SEC24CP53992 1094 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 LILRA4P59901 499 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DAG1Q14118 895 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PLA1AQ53H76 456 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SESTD1Q86VW0 696 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 VRK3Q8IV63 474 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MAML1Q92585 1016 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FBXL20Q96IG2 436 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KLC4Q9NSK0 619 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms